【ED】エンディング１～３はそれぞれ別の世界線なのですか？

全て「火山の噴火があったが、本来死んでいたはずの島民が生還した」という同じ世界線です。

乗船券の使い方によって各自主観のエンディング描写が異なっているだけとお考えください。